Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rps6ka3P18654 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps6ka3P18654 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka3P18654 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms