Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim30aP15533 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30aP15533 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30aP15533 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms