Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtcP11725 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtcP11725 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtcP11725 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtcP11725 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtcP11725 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtcP11725 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtcP11725 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtcP11725 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtcP11725 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtcP11725 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtcP11725 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtcP11725 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtcP11725 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtcP11725 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtcP11725 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtcP11725 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtcP11725 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtcP11725 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtcP11725 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtcP11725 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtcP11725 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtcP11725 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtcP11725 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtcP11725 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtcP11725 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtcP11725 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtcP11725 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtcP11725 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtcP11725 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtcP11725 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtcP11725 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtcP11725 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtcP11725 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtcP11725 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtcP11725 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtcP11725 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtcP11725 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtcP11725 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtcP11725 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtcP11725 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtcP11725 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtcP11725 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtcP11725 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OtcP11725 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtcP11725 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtcP11725 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtcP11725 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtcP11725 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtcP11725 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtcP11725 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtcP11725 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtcP11725 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtcP11725 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtcP11725 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtcP11725 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtcP11725 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtcP11725 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtcP11725 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms