Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatspereP0DP43 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CatspereP0DP43 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms