Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna4P07351 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna4P07351 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms