Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Eb1P04230 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms