Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
P04214 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04214 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04214 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04214 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04214 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04214 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04214 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P04214 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P04214 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P04214 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04214 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04214 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04214 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04214 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04214 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P04214 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P04214 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P04214 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P04214 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P04214 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P04214 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P04214 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P04214 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P04214 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P04214 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04214 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04214 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04214 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04214 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P04214 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
P04214 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
P04214 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04214 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04214 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04214 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04214 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04214 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04214 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04214 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04214 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04214 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04214 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04214 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04214 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04214 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04214 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04214 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04214 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04214 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04214 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04214 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04214 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P04214 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04214 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P04214 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P04214 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P04214 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04214 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P04214 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04214 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P04214 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04214 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P04214 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04214 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04214 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04214 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04214 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04214 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04214 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P04214 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04214 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04214 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04214 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04214 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04214 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04214 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04214 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04214 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04214 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04214 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P04214 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P04214 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P04214 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P04214 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P04214 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04214 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04214 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04214 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04214 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04214 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04214 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04214 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04214 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04214 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04214 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04214 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04214 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P04214 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04214 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms