Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GzmbP04187 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GzmbP04187 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GzmbP04187 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GzmbP04187 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GzmbP04187 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms