Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Ab1P01921 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms