Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01783 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01783 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01783 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01783 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01783 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01783 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01783 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01783 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01783 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01783 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01783 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01783 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01783 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01783 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01783 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01783 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01783 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01783 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01783 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01783 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01783 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01783 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01783 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01783 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01783 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01783 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01783 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01783 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01783 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01783 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01783 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01783 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01783 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01783 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01783 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01783 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01783 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01783 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01783 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01783 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01783 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01783 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01783 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01783 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01783 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01783 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms