Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01741 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01741 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01741 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01741 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01741 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01741 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01741 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01741 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01741 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01741 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01741 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01741 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01741 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01741 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01741 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01741 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01741 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01741 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01741 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01741 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01741 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01741 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01741 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01741 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01741 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01741 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01741 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01741 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms