Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01729 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01729 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01729 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01729 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01729 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01729 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01729 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01729 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01729 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01729 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01729 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01729 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01729 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01729 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01729 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01729 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01729 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01729 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01729 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01729 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01729 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01729 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01729 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01729 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01729 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01729 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01729 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01729 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01729 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01729 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01729 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01729 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01729 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01729 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms