Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Apba3O88888 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apba3O88888 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba3O88888 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba3O88888 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba3O88888 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba3O88888 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apba3O88888 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba3O88888 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba3O88888 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba3O88888 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba3O88888 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms