Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nid2O88322 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nid2O88322 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nid2O88322 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nid2O88322 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nid2O88322 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nid2O88322 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nid2O88322 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nid2O88322 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nid2O88322 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nid2O88322 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nid2O88322 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nid2O88322 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms