Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx3O70492 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx3O70492 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx3O70492 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx3O70492 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx3O70492 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx3O70492 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx3O70492 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx3O70492 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx3O70492 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx3O70492 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snx3O70492 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx3O70492 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx3O70492 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx3O70492 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx3O70492 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx3O70492 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx3O70492 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx3O70492 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx3O70492 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx3O70492 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx3O70492 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx3O70492 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx3O70492 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx3O70492 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx3O70492 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx3O70492 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx3O70492 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx3O70492 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx3O70492 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms