Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EomesO54839 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EomesO54839 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EomesO54839 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EomesO54839 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EomesO54839 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EomesO54839 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EomesO54839 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EomesO54839 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EomesO54839 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EomesO54839 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EomesO54839 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EomesO54839 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EomesO54839 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EomesO54839 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EomesO54839 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EomesO54839 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EomesO54839 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EomesO54839 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EomesO54839 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EomesO54839 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EomesO54839 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EomesO54839 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EomesO54839 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EomesO54839 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EomesO54839 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EomesO54839 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EomesO54839 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EomesO54839 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EomesO54839 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EomesO54839 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EomesO54839 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EomesO54839 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EomesO54839 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EomesO54839 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EomesO54839 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EomesO54839 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EomesO54839 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EomesO54839 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EomesO54839 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EomesO54839 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EomesO54839 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EomesO54839 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EomesO54839 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EomesO54839 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EomesO54839 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EomesO54839 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EomesO54839 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EomesO54839 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EomesO54839 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EomesO54839 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EomesO54839 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EomesO54839 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EomesO54839 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EomesO54839 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EomesO54839 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EomesO54839 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EomesO54839 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EomesO54839 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EomesO54839 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EomesO54839 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EomesO54839 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EomesO54839 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EomesO54839 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EomesO54839 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EomesO54839 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EomesO54839 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EomesO54839 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EomesO54839 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EomesO54839 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EomesO54839 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EomesO54839 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EomesO54839 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EomesO54839 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EomesO54839 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EomesO54839 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EomesO54839 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms