Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr6O54689 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr6O54689 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms