Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab33bO35963 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms