Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited2O35740 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited2O35740 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited2O35740 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited2O35740 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cited2O35740 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cited2O35740 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited2O35740 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited2O35740 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited2O35740 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited2O35740 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited2O35740 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited2O35740 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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