Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx1aO35526 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx1aO35526 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx1aO35526 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms