Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr6O35347 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dgcr6O35347 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dgcr6O35347 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms