Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sypl1O09117 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl1O09117 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms