Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfra2O08842 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gfra2O08842 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms