Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcof1O08784 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcof1O08784 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tcof1O08784 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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