Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U90926O08546 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U90926O08546 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U90926O08546 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U90926O08546 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U90926O08546 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U90926O08546 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U90926O08546 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
U90926O08546 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U90926O08546 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U90926O08546 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U90926O08546 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U90926O08546 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U90926O08546 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U90926O08546 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
U90926O08546 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
U90926O08546 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
U90926O08546 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
U90926O08546 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U90926O08546 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U90926O08546 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U90926O08546 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U90926O08546 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U90926O08546 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U90926O08546 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U90926O08546 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U90926O08546 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U90926O08546 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U90926O08546 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U90926O08546 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U90926O08546 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U90926O08546 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U90926O08546 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U90926O08546 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
U90926O08546 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U90926O08546 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U90926O08546 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U90926O08546 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms