Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3488M0QW81 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3488M0QW81 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3488M0QW81 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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