Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccer2J3QPU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccer2J3QPU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccer2J3QPU5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccer2J3QPU5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccer2J3QPU5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccer2J3QPU5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccer2J3QPU5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccer2J3QPU5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccer2J3QPU5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccer2J3QPU5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms