Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20914J3QME2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20914J3QME2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20914J3QME2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms