Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hmgxb3G3X9M3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hmgxb3G3X9M3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hmgxb3G3X9M3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms