Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms