Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r76F8VQ63 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms