Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms