Protein–RNA interactions for Protein: F6WEU2

Ccdc188, Coiled-coil domain-containing 188, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc188F6WEU2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc188F6WEU2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc188F6WEU2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc188F6WEU2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc188F6WEU2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms