Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phldb3E9QAF4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phldb3E9QAF4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Phldb3E9QAF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phldb3E9QAF4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms