Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc74aE9Q9U8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc74aE9Q9U8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms