Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nolc1E9Q5C9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nolc1E9Q5C9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nolc1E9Q5C9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nolc1E9Q5C9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms