Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0R1

Gm8159, Predicted gene 8159, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8159E9Q0R1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8159E9Q0R1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8159E9Q0R1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8159E9Q0R1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms