Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc78D3Z5T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc78D3Z5T1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms