Protein–RNA interactions for Protein: A6H6E9

Ttc23l, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23lA6H6E9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc23lA6H6E9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc23lA6H6E9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc23lA6H6E9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms