Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf39A2RT81 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf39A2RT81 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf39A2RT81 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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