Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931406B18RikA2RSL7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4931406B18RikA2RSL7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4931406B18RikA2RSL7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms