Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ism1A2ATD1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ism1A2ATD1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ism1A2ATD1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms