Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn1aA2APX8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn1aA2APX8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn1aA2APX8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms