Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Camsap1A2AHC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Camsap1A2AHC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Camsap1A2AHC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Camsap1A2AHC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Camsap1A2AHC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Camsap1A2AHC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Camsap1A2AHC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Camsap1A2AHC3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Camsap1A2AHC3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camsap1A2AHC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms