Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ambra1A2AH22 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ambra1A2AH22 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ambra1A2AH22 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms