Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd4A2AFR3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd4A2AFR3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms