Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2aA2A9G7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2aA2A9G7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms