Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RlfA2A7F4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RlfA2A7F4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RlfA2A7F4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RlfA2A7F4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RlfA2A7F4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RlfA2A7F4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RlfA2A7F4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms