Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc112A0AUP1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc112A0AUP1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc112A0AUP1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc112A0AUP1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc112A0AUP1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms