Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SQF0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1L1SQF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1L1SQF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1L1SQF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1L1SQF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1L1SQF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A1L1SQF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1L1SQF0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1L1SQF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms